Основним завданням методики є досягення «стану внутрішньої цілісності». Стану внутрішньої цілісності, максимально повної, гармонійної та ефективної взаємодії різних частин тіла між собою, в будь-якому положенні тіла в просторі. Замість того, щоб  розтягувати окремі частини тіла, окремі м'язи, ми просто балансуємо їх стан відносно інших м'язів.

Стан внутрішньої цілісності це стан, в якому:
- вся рухальна(рознішня) мускулатура збалансована. М'язи знаходяться в проміжному, середньому стані між повним розслабленням та крайнім напруженням, і робота м'язів антагоністів збалансована між собою.
- всі частини тіла максимально пов'язані між собою за рахунок включення в роботу суглобово-зв'язкового апарату та глибокої дрібної мускулатури.

Ішвара Йога, як методика, базується  на двох аспектах:
1. Внутрішні принципи роботы з тілом - детальні пояснення того, як правильно виконується будь-яка, окремо взята вправа, рух або ж положення тіла в просторі.
2. Принципи побудови тренувальних програм, одного заняття чи тренувального процесу вцілому. Вони засновані  на детальній класифікації вправ, яка дозволяє точно підібрати набір вправ, максимально ефективний для кожного практикуючого в залежності від його рівня підготовки, фізичних особливостей та поставлених задач.